José Palmeira é Professor Auxiliar do Departamento de Ciência Política, na Escola de Economia e Gestão da Universidade do Minho. Integra a direção da Seção de Estudos Europeus da Associação Portuguesa de Ciência Política. Desempenhou, entre outros, os cargos de presidente do Conselho de Cursos de Ciências Económicas, Empresariais e Políticas e de diretor da Seção de Ciência Política e Relações Internacionais, além de ter dirigido as licenciaturas e mestrados em Relações Internacionais e em Ciência Política. Foi também diretor do Núcleo de Investigação em Ciência Política e Relações Internacionais e da sua revista (Perspectivas), bem como representante oficial do ECPR (European Consortium for Political Research).
José Palmeira é atualmente um dos Editores da Perspectivas – Journal of Political Science.